??.??.2003 VR avasi lippujen verkkokaupan vuoden 2003 maaliskuussa. Internetissä lippuvalikoimassa ovat siitä alkaen olleet yleisimmät kaukoliikenteen junaliput. Niitä ovat aikuisten normaalihintaiset junaliput, opiskelijaliput, lehdistöliput, junioriliput, senioriliput, eläkeläisliput, varusmiesten ja siviilipalvelusmiesten alennushintaiset liput, perheliput sekä ryhmäliput 3-8 hengen ryhmille.VR:stä korostettiin, että verkkokaupasta voi hankkia kaukoliikenteen yleisimpiä junalippuja InterCity-, Pendolino-, pika- ja taajamajuniin. Tässä verkkokaupan ensimmäisessä vaiheessa verkosta ei voinut vielä ostaa esimerkiksi makuupaikkoja, sarjalippuja eikä pääkaupunkiseudun lähiliikenteen lippuja.
Verkkokaupasta ostetut junaliput jouduttiin noutamaan asemien junamaateista, lipunmyynnistä tai ne sai tilata postitse kotiin. Internetistä ostetun junalipun sai kolme prosenttia edullisemmin kuin VR:n lipunmyynnistä. Junalippuostoksien tekeminen Internetissä edellytti Nordean, Sammon tai Osuuspankin verkkopankkiyhteyttä. Myös Luottokunnan korteilla (Visa, Eurocard tai Mastercard) sai maksaa. Visa Electron ei käynyt
. Samassa yhteydessä verkkokaupan avaamisen kanssa VR otti käyttöön 400 saksalaisen Höft & Wessel -yhtymän langattomaan teknologiaan perustuvaa päätelaitetta konduktöörien käyttöön. Muutos tiesi etua luotto- ja pankkikorttimaksajalle, kun lipun käsin kirjoittamisesta peritty 15 markan käsittelymaksu poistui.
Seuraavana vuonna VR Osakeyhtiö ottti koekäyttöön e-lipun. Asiakas sai itse tulostaa kaukoliikenteen junalipun omalla kirjoittimellaan tai tilata sen tekstiviestinä matkapuhelimeensa. Tämä e-lippu oli sikäli muista lipuista poikkeava, että sen saattoi peruuttaa jos asiakkaan matkasuunnitelmat olivat muuttuneet ja matka oli jäänyt tekemättä, mutta siitä ei maksettu rahaa takaisin.
Vielä myöhemmin keväällä VR lisäsi valinnanvaraa verkkokauppaan VR:n verkkokaupassa saattoi nyt itse määritellä, millaisen istumapaikan junasta halusi. Pendolino-, InterCity- ja pikajunista voi valita ikkuna- tai käytäväpaikkoja. Järjestelmä haki automaattisesti vierekkäiset paikat esimerkiksi kahden junalipun ostajalle.
Uutta oli myös se, että verkkokaupasta sai nyt ostaa istumapaikkoja lemmikkivaunuun tai -osastoon, pyörätuoli- ja allergiapaikkoja sekä paikkoja video- ja puuhavaunuihin, perhehytteihin ja leikkitilojen läheisyyteen. Tähän mennessä verkkokaupan asiakas oli voinut vain esittää toivomuksen ylä- tai alakerran paikasta InterCity-junissa.
VR Henkilöliikenteen internet lipunmyynnin alussa samanaikaisesti käynnistämä it-pohjainen puhelin- ja palvelukeskus oli Eterran ja sen kumppaniyrityksen Wicom Commications Oy:n käsialaa.VR halusi selkeyttää palvelua luomalla yhtenäiset numerot koko Suomeen, kertoi Yhteyskeskushankkeen hankekoordinaattorina toiminut Anu Autio VR:stä. Puheluihin vastasi kahdessa vuorossa yhteensä noin 150 asiakasneuvojaa eri puolilta Suomea joko Riihimäen Yhteyskeskuksessa tai missä tahansa Yhteyskeskukseen kytketyistä kahdestatoista etäpisteestä.
- Meillä oli tavoitteena lyhentää asiakkaiden jonotusaika 30 sekuntiin ja uuden teknologian käyttö mahdollisti sen. Nyt pystymme tarjoamaan samat palvelut kaikille asiakkaille, soittivatpa he Rovaniemeltä tai Lohjalta, Autio painotti.
Näin käynnistyi lipunmyynti verkossa internet aikakaudelle tultaessa. Tuon ajankohdan jälkeen on ollut useita lipunmyynnin päivityksiä ja kyllä niissä on omat kantonsa kaskessa ollut. lippujårjestelmänsä täysin 2011 uusinut VR on uuden, kysyntäpohjaiseen hinnoitteluun tähtäävän järjestelmänsä kanssa saanut ankaraa kritiikkiä järjestelmän jumiuduttua heti käyttöönottopäivänä.VR:n palveluheikennykset ja lippu-uudistukset ovat herättäneet kiukkua etenkin paljon matkustavissa. Tuorein esimerkki on uusi sarjalipun paikkavarauspakko.